TM Software, Inc.: ケーススタディ

ケーススタディ

会社概要

	相同性検索の効率化
	ご相談内容
	DDBJの相同性検索を利用する際、BLASTならまだしもFASTAやSmith-Watermanだと検索に時間がかかるので、一々結果が出るのを待ってから検索配列をひとつずつ入力するのは面倒だ。
	TMソフトウェアの解決策
	検索配列データを連続してDDBJに自動投入後検索結果を自動的に取り出して、その結果の中から必要なデータのみを抽出、整理した表を作成するシステムをリナックス用に開発。配列数千個規模の相同性検索は放っておけば終わります。

	マイクロアレイデータベースの開発
	ご相談内容
	大量に出てくるマイクロアレイのデータをエクセルで管理して別のソフトでクラスタリングしているが、データを一元的に管理してクラスタリング処理も同じソフトを使って簡単に処理したい。
	TMソフトウェアの解決策
	リナックス上でオラクルデータベースを用い、ウェブアプリケーションを開発しました。クラスタリングも階層的クラスタリング、k-means、SOMの各手法をサポート。結果はきれいなグラフィックスで表示されます。